A Műegyetem az országban elsőként vezette be a szervezett doktori képzést (PhD fokozat). Emellett a művészeti doktori fokozat (Doctor of Liberal Arts, DLA) az építészet magas szintű ismeretét és az önálló alkotó művelésre való alkalmasságot tanúsítja.
A karok doktori képzéses oldalai:
Vegyészmérnöki és Biomérnöki Kar
Villamosmérnöki és Informatikai Kar
Közlekedésmérnöki és Járműmérnöki Kar
Gazdaság- és Társadalomtudományi Kar
További információ: BME Doktori Iskolák